Trung tâm Y tế quận 5 được thành lập vào tháng 7/1993, dưới sự quản lý chỉ đạo và hướng dẫn, kiểm tra của Sở Y Tế Tp Hồ Chí Minh về chuyên môn; Và sự quản lý, chỉ đạo của Ủy Ban Nhân Dân Quận 5 trong việc xây dựng kế hoạch phát triển y tế trên địa bàn quận 5.
Là đơn vị hành chánh - sự nghiệp và quản lý Nhà nước về y tế. Nhiệm vụ chủ yếu là khám chữa bệnh nội, ngoại trú, kết hợp y học hiện đại với y học cổ truyền; dự phòng; phòng chống dịch bệnh, sốt rét, bướu cổ và các bệnh xã hội; bảo vệ sức khỏe bà mẹ trẻ em và nhiệm vụ chuyên môn kỹ thuật về kế hoạch hóa gia đình.